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(二)E基因序列扩增及序列同源性分析
24份登革热病毒核酸阳性标本经扩增获得24个完整的E基因序列并命名为DENV-1/NB/NJX-01/2018~DENV-1/NB/NJX-24/2018,核苷酸长度均为1 485bp,编码495个氨基酸。与Genbank数据库中的序列进行比对结果显示,24个序列均为DENV-1型。对获得的24个E基因序列与国内外流行株及分型参考株进行同源性分析。基因进化树显示(图1-4),本次登革热暴发疫情分离株高度聚集为一个亚支,属于GI基因型,与中国、缅甸、马来西亚等地的亚洲一带GI型毒株关系较近,尤其与2015年从缅甸输入中国台湾的Myanmar/2015/MG894863亲缘关系最近,但与原型株Hawaii/1944/KM204119亲缘关系已相距较远。24株宁波株与7株GI参考株E基因间的核苷酸和氨基酸相似性分别为98.0%~99.7%和96.6%~98.2%,同源性较高;与原型株Hawaii/1944/KM204119的核苷酸和氨基酸相似性仅为94.5%~94.8%和92.1%~92.5%。

图1-4 登革热暴发疫情中24份E基因同源性分析
问题8 你认为此时的工作重点是什么?请制订下一步现场工作方案。
问题9 请制订一份现场快速灭蚊技术方案。